Пополнены базы данных для Электронного эпидемиологического атласа ПФО
13  12.2017
Электронный эпидемиологический атлас ПФО дополнен базами данных по заболеваемости за 2016 год.
IX Всероссийская научно-практическая конференция молодых ученых и специалистов Роспотребнадзора
11  12.2017
5-7 декабря 2017г. в городе Иркутск прошла IX Всероссийская научно-практическая конференция молодых ученых и специалистов Роспотребнадзора «Современные проблемы эпидемиологии и гигиены».

Новый сервис для анализа результатов полногеномного секвенирования

Главная  »  Новости  »  Новый сервис для анализа результатов полногеномного секвенирования
Версия для печати
Новый сервис для анализа результатов полногеномного секвенирования
24  11.2017
На базе сервера института развернута система, позволяющая проводить анализ результатов полногеномного секвенирования (NGS). Сервис доступен всем желающим.

Система "EDGE bioinformatics" (Los Alamos National Security) позволяет проводить типовой анализ результатов секвенирования (NGS) без необходимости привлечения высококвалифицированного специалиста в области биоинформатики.

Система позволяет проводить следущие виды анализа:

  • контролировать качество чтений
  • собирать геном de novo
  • аннотировать геномы
  • выравнивать чтения на референсную последовательность
  • строить филогенетические деревья
  • проводить таксономическую классификацию метагеномных образцов
  • выявлять факторы вирулентности и антибиотикорезистентности патогенов

На сегодняшний день система "EDGE bioinformatics" развернута на базе сервера инстиута. Использование системы доступно всем пользователям после регистрации (по запросу на адрес solntsev.l.a@nniiem.ru).

Перейти на сервис "EDGE bioinformatics"

Федеральная служба по надзору в сфере защиты прав потребителей и благополучия человека
(831) 469-79-01