Волго-Вятский научно-практический центр по индикации, идентификации и таксономии микроорганизмов и организации противоэпидемической работы в экстремальных условиях
Волго-Вятский региональный научно-практический центр по индикации, идентификации и таксономии микроорганизмов и организации противоэпидемической работы в экстремальных условиях (в дальнейшем Центр) организован на базе Нижегородского НИИ эпидемиологии и микробиологии согласно приказу Государственного Комитета санитарно-эпидемиологического надзора РФ № 16 от 08.02.1993 и N2 от 3.01.1995 г.
В настоящее время Центр использует в своей работе комплекс наиболее современных молекулярно-биологических методов индикации и типирования вирусов и бактерий, таких как полимеразная цепная реакция (ПЦР), ДНК-зонды, определение процента ГЦ оснований, тотальная ДНК-ДНК гибридизация, анализ плазмидных профилей бактерий, рестрикционный анализ ДНК.
Центр оказывает помощь учреждениям практического здравоохранения по следующим направлениям:
1. Эпиднадзор за возбудителями ОКИ.
На базе детской инфекционной больницы N8 г. Н.Новгорода испытана экспериментальная ПЦР-тест-система для выявления бактерий рода Шигелла и энтероинвазивных эшерихий и комплекс из 4 ПЦР тест – систем для детекции наиболее распространенных бактериальных возбудителей ОКИ – бактерий родов Шигелла, Сальмонелла, Кампилобактер и Эрсиния энтероколитика Исследовано 335 образцов копроматериала и 47 чистых культур, выделенных от больных детей. Показана высокая специфичность и чувствительность тест-системы. Эффективность обнаружения инфекционного агента при этом была в 1,5 выше, чем традиционным бактериологическим методом, а для шигелл - в 2,3 раза выше.
Следует отметить, что микробиологические исследования по выявлению кампилобактеров и эрсиний в настоящее время практически не проводятся и ПЦР – детекция является пока единственной возможностью отслеживать циркуляцию этих микроорганизмов.
С 2004 года комплексные ПЦР-исследования по выявлению бактериальных возбудителей ОКИ проводятся на базе инфекционной больницы № 9 г .Н.Новгорода. К настоящему времени обследовано более 450 больных.
В связи с крупной вспышкой ОКИ в г.Кстово Нижегородской области осенью 2005 г . проведены исследования на выявление бактерий родов Шигелла, Сальмонелла, Кампилобактер, Ерсиния энтероколитика в пробах молочных продуктов, смывов с фруктов, смывов с оборудования Кстовского молочного комбината, ректальных проб сотрудников комбината, проб воды, всего 190 образцов, 450 ПЦР исследований. В результате удалось выявить шигеллы в образце масла Кстовского молочного комбината и в ректальных пробах 2 сотрудников этого предприятия.
По заявке отдела особо опасных инфекций Нижегородского областного центра санэпиднадзора в 2002 г . проведено изучение атипичного штамма холерного вибриона. Использована ПЦР тест система для детекции Vibrio cholerae, (разработка Института Микробиологии Мин.обороны РФ). Изучаемый штамм идентифицирован как нетоксигенный вибрион, имеющий гены адгезии, сходные с таковыми V.cholerae.
Освоена ПЦР-детекция энтеробактерий, имеющих гены шигаподобного, термолабильного, термостабильного токсинов. По заявке кафедры эпидемиологии Нижегородской мед.академии проведено исследование 350 штаммов клинических изолятов шигелл. Обнаружены единичные штаммы, содержащие ген шигатоксина 1 типа.
По заявке Городского центра санэпиднадзора Н.Новгорода проведен анализ плазмидных профилей 43 штаммов Salmonella typhimurium, выделенных от больных и носителей при вспышечной заболеваемости в стационарах Автозаводского, Московского и Сормовского районов города в 2002-2003 гг.
2. Мониторинг за возбудителями негонококковых урогенитальных инфекций (НУГИ): хламидиями, микоплазмами, уреаплазмами, вирусами группы герпеса.
Проведено ПЦР обследование на наличие возбудителей НУГИ 860 беременных женщин с отягощенным акушерско-гинекологическим анамнезом и с воспалительными заболеваниями органов мочеполовой системы.
Проводятся исследования секционного материала от мертворожденных и умерших новорожденных на наличие возбудителей внутриутробных инфекций. Всего за отчетный период проведен анализ 429 образцов на 8 инфекционных агентов каждый.
Выявлено стабильное сохранение тенденции циркуляции возбудителей НУГИ в условиях крупного промышленного центра (г.Н.Новгород) на протяжении всех лет наблюдений.
3. Эпиднадзор за парентеральными вирусными гепатитами (B,C,D,G,TTV).
Центром осуществляется определение вирусной нагрузки при гепатитах, а для вируса гепатита С - определение 4 доминирующих генотипов (1а, 1b, 2, 3a), динамический контроль результатов противовирусной терапии. По договору с фамацевтической компанией "Шеринг Плау" США проведено обследование 65 человек, проходивших в течение полугода курс двойной противовирусной терапии (интрон, ребетол). В настоящее время аналогичные работы ведутся по хоздоговору с Московским филиалом фармацевтической компании "Хоффман ля Рош" (Швейцария) – обследовано 138 человек, с фирмой Тева (Москва) – обследовано 47 человек, Фирмой Фармапарк – обследовано 26 человек и совместно с кафедрой инфекционных болезней Нижегородской медакадемии - обследовано 50 человек.
Проводится обследование доноров крови и плазмоферреза на наличие вирусов гепатита С, В. С августа 2002 г . проанализирован 871 образец крови на наличие ДНК ВГВ и 875 образцов крови на наличие РНК. РНК ВГС выявлена в 7,5% случаев. ДНК ВГВ – в 2,8%. данная работа проводится по хоздоговору с Областной станцией переливания крови.
Проведено обследование на наличие вирусов гепатита С и В 145 беременных женщин, имеющих белковые маркеры этих инфекционных агентов, 364 детей первых 3 лет жизни из группы риска (рожденных женщинами, инфицированными вирусами гепатита С и В).
4. ПЦР-диагностика хеликобактериоза при различных формах гастродуоденальной патологии.
За отчетный период дополнительно к методу ПЦР-детекции хеликобактера пилорического освоено выявление генов факторов патогенности CagA и VacA, разработан метод гетеродуплексного анализа H.pylori по последовательности участка гена CagA.
В ходе совместных научно-исследовательских работ с факультетом усовершенствования врачей, кафедрой общей и клинической фармакологии Нижегородской медакадемии, санаторием имени ВЦСПС (Нижегородская область) проведено 174 ПЦР-исследования на хеликобактер и его факторы патогенности.
Кроме представленных выше 4-х традиционных направлений работы, в Центре с 2002 года проводятся:
• Выявление методом ПЦР возбудителей гнойных менингитов: Streptococcus pneumoniae , Neiseria meningitidis , Haemophillus influenzae . К настоящему времени проведено обследование 164 человек с диагнозом менингит и с подозрением на менингит.
• По запросу практического здравоохранения с октября 2002 г . ведутся работы по ПЦР-детекции возбудителя клещевого боррелиоза и коклюша.
• К настоящему времени в Центре методом ПЦР определяется более 30 наиболее практически значимых возбудителей бактериальных и вирусных инфекций.
• Разработаны варианты мобильных ПЦР лабораторий на базе автомобиля «Газель» для классического трехстадийного варианта ПЦР и для технологии ПЦР в режиме реального времени.
• Оказана методическая помощь ПЦР-лабораториям Нижегородского предприятия бакпрепаратов «ИМБИО», Сормовского КВД, Нижегородского областного КВД, областной детской клинической больницы, областной станции переливания крови. Проведено обучение методу ПЦР диагностики сотрудника Чувашского республиканского центра СЭН, сотрудника лаборатории особо опасных инфекций Нижегородского областного центра СЭН, сотрудника Нижегородского предприятия бакпрепаратов «ИМБИО»; методу анализа плазмидных профилей - сотрудника кафедры эпидемиологии Нижегородской медакадемии и аспиранта института микробиологии им. Заболотного академии наук Украины.
Перспективные направления для расширения работ и номенклатуры услуг Центра:
• проведение ПЦР диагностики в ветеринарии, наиболее значимыисследования по выявлению микроорганизмов (микоплазмы, хламидии), вызывающих нарушение репродукции элитных сельскохозяйственных животных; выявление возбудителей туберкулеза и лейкоза крупного рогатого скота;
• ПЦР исследование генноинженерно-модифицированных продуктов, проверка комбикормов на содержание белков организма крупного рогатого скота (предотвращение распространения преоновой болезни).
• освоение метода рестрикционного анализа хромосомной ДНК бактерий с использованием крупнощепящих рестриктаз для эпидмаркирования штаммов.
Подготовлены и направлены в Минздравсоцразвития РФ материалы для преобразования "Волго-Вятского регионального научно-практического центра по индикации, идентификации и таксономии микроорганизмов и организации противоэпидемической работы в экстремальных условиях" в Приволжский окружной центр с аналогичным названием. Наряду с уже имеющимися функциями в новом Положении о Центре предусмотрена возможность контроля Центром действующих практических ПЦР-лабораторий на территории округа.
