Новый сервис для анализа результатов полногеномного секвенирования
Версия для печати |
24 11.2017
На базе сервера института развернута система, позволяющая проводить анализ результатов полногеномного секвенирования (NGS). Сервис доступен всем желающим.
|
Система "EDGE bioinformatics" (Los Alamos National Security) позволяет проводить типовой анализ результатов секвенирования (NGS) без необходимости привлечения высококвалифицированного специалиста в области биоинформатики.
Система позволяет проводить следущие виды анализа:
- контролировать качество чтений
- собирать геном de novo
- аннотировать геномы
- выравнивать чтения на референсную последовательность
- строить филогенетические деревья
- проводить таксономическую классификацию метагеномных образцов
- выявлять факторы вирулентности и антибиотикорезистентности патогенов
На сегодняшний день система "EDGE bioinformatics" развернута на базе сервера инстиута. Использование системы доступно всем пользователям после регистрации (по запросу на адрес solntsev.l.a@nniiem.ru).
