24 марта - Всемирный день борьбы с туберкулезом
19  03.2019
24 марта, в день открытия возбудителя туберкулеза, по решению Всемирной организации здравоохранения (ВОЗ) отмечают Всемирный день борьбы с туберкулезом (World Tuberculosis Day).
Ученики школы робототехники посетили ННИИЭМ с экскурсией
19  03.2019
18 марта 2019г. ученики "Школы информационных технологий" посетили институт с ознакомительной экскурсией.

Новый сервис для анализа результатов полногеномного секвенирования

Главная  »  Новости  »  Новый сервис для анализа результатов полногеномного секвенирования
Версия для печати
Новый сервис для анализа результатов полногеномного секвенирования
24  11.2017
На базе сервера института развернута система, позволяющая проводить анализ результатов полногеномного секвенирования (NGS). Сервис доступен всем желающим.

Система "EDGE bioinformatics" (Los Alamos National Security) позволяет проводить типовой анализ результатов секвенирования (NGS) без необходимости привлечения высококвалифицированного специалиста в области биоинформатики.

Система позволяет проводить следущие виды анализа:

  • контролировать качество чтений
  • собирать геном de novo
  • аннотировать геномы
  • выравнивать чтения на референсную последовательность
  • строить филогенетические деревья
  • проводить таксономическую классификацию метагеномных образцов
  • выявлять факторы вирулентности и антибиотикорезистентности патогенов

На сегодняшний день система "EDGE bioinformatics" развернута на базе сервера инстиута. Использование системы доступно всем пользователям после регистрации (по запросу на адрес solntsev.l.a@nniiem.ru).

Перейти на сервис "EDGE bioinformatics"

Федеральная служба по надзору в сфере защиты прав потребителей и благополучия человека
(831) 469-79-01
События