Лаборатория молекулярной эпидемиологии вирусных инфекций

Заведующий лабораторией Заслуженный работник здравоохранения Российской Федерации, доктор биологических наук, профессор Новикова Надежда Алексеевна

Как самостоятельное структурное подразделение института лаборатория организована в 1992 году. 

На базе лаборатории функционирует Референс-центр по мониторингу энтеровирусных инфекций (Приказы Роспотребнадзора от 17.03.2008 г. №88, от 01.12.2017 г. №1116). 

Основные научные направления лаборатории:

• Изучение генетического и антигенного разнообразия возбудителей острых кишечных инфекций на основе ПЦР-типирования, секвенирования, исследования нуклеотидных последовательностей и филогенетического анализа.
• Выявление и характеристика эпидемических вариантов ротавирусов и норовирусов, изучение их молекулярной эволюции и анализ внутренних механизмов развития эпидемического процесса.
• Идентификация и изучение биологических, молекулярно-генетических характеристик возбудителей энтеровирусных инфекций, в том числе энтеровирусов новых типов и выявленных при атипичных клинических формах энтеровирусной инфекции. Анализ эпидемиологических рисков, связанных с заносом и распространением эпидемических вариантов энтеровирусов на территории РФ.
• Совершенствование методологии молекулярно-эпидемиологического мониторинга энтеровирусных инфекций.
• Оказание консультативно методической и практической помощи органам и учреждениям Роспотребнадзора и медицинским организациям при проведении лабораторных исследований и мониторинга энтеровирусных инфекций.

Основные научные достижения:

• Разработаны лабораторные методы обнаружения и генотипирования кишечных вирусов: электорофоретипирования РНК ротавирусов в ПААГ, определения G- и Р-генотипа ротавирусов, геногруппы энтеро- и калицивирусов с использованием ОТ-ПЦР, которые защищены авторскими свидетельствами и патентами, а также идентификации типа и штаммовых характеристик вирусов путем секвенирования участков генома. В международном банке нуклеотидных последовательностей депонировано 484 фрагмента генома кишечных вирусов
• Показано антигенное и генетическое разнообразие ротавирусов, дана молекулярно-генетическая характеристика современных штаммов ротавируса вида Rotavirus А: охарактеризован новый для европейской части России вариант ротавируса G9P[8]; показаны эволюционные изменения гена основного капсидного белка VP7 ротавирусов генотипа G1P[8], выявлены и проанализированы редкие генетические варианты ротавирусов (G3P[9], G6P[9], G12P[8]). На основе результатов филогенетического анализа и исследования аминокислотного состава белков наружного капсида вириона выявлены различные варианты ротавируса, характерные для Нижнего Новгорода и других городов России. Полученные знания доложены на всероссийских и международных конференциях.
• Определены генотипы и геноварианты норовирусов, циркулировавших среди населения г. Нижнего Новгорода в течение последнего десятилетия, показана смена эпидемических вариантов норовирусов генотипа GII.4 на изучаемой территории, синхронизированная с глобальными процессами в вирусных популяциях. На основе генотипирования установлено, что межтиповая  и межвариантная рекомбинация является в настоящее время одним из основных механизмов эволюции норовирусов.
• Разработана методология типирования энтеровирусов с использованием молекулярно-генетических методов исследования. На основе анализа установленных нуклеотидных последовательностей фрагментов генома энтеровирусов, выявленных на территории 70 субъектов 8-ми ФО РФ, охарактеризован пейзаж неполиомиелитных энтеровирусов, циркулирующих среди населения России, представленный 54 типами. В международном банке нуклеотидных последовательностей депонирован 461 фрагмент генома 381 штамма энтеровирусов 25-ти типов. Охарактеризована этиологическая структура энтеровирусного менингита и энтеровирусных экзантемных заболеваний в Российской Федерации. Изучена молекулярная эпидемиология энтеровирусов, обусловивших подъемы заболеваемости энтеровирусным менингитом и энтеровирусной инфекцией в 2007-2018 гг. в целом по России и на отдельных территориях (ЕСНО30, ЕСНО9, Коксаки А6, Энтеровирус А71 и др.).
• Разработаны методики выявления и генотипирования парэховирусов человека, вызывающих заболевания, сходные по клиническим проявлениям с энтеровирусной инфекцией. Впервые показана широкая циркуляция парэховирусов человека среди населения России, изучено их типовое и генетическое разнообразие.

перечень наиболее значимых публикаций 

Перечень лабораторно-диагностических услуг, предлагаемых заинтересованным организациям и физическим лицам на договорной основе:

• Выявление вирусных (ротавирус/норовирус/астровирус/аденовирус) и бактериальных (Salmonella spp./Shigella spp./ энтероинвазивные E.Coli/Campylobacter spp.)  возбудителей острых кишечных инфекций методом ОТ-ПЦР с детекцией в режиме реального времени
• Выявление энтеровирусов у больных с различными клиническими проявлениями с подозрением на энтеровирусную инфекцию методом ОТ-ПЦР с детекцией в режиме реального времени
• Экспресс-выявление антигенов кишечных вирусов (ротавирус/аденовирус) иммунохроматографическим методом

подробнее

Контактный телефон (831) 469-79-12 Новикова Надежда Алексеевна

E-mail: mevirfc@rambler.ru

Адрес: 603950, ул. Малая Ямская, д. 71, 3 этаж

наверх